吸引多元化主體參與孵化聯(lián)盟。成熟的孵化聯(lián)盟應(yīng)包括政府部門、科技企業(yè)孵化器、創(chuàng)業(yè)企業(yè)、創(chuàng)投機構(gòu)、科研機構(gòu)、中介服務(wù)機構(gòu)等與科技創(chuàng)業(yè)相關(guān)的各類主體。為此，政府應(yīng)制定相應(yīng)政策鼓勵科技服務(wù)主體加入聯(lián)盟。孵化聯(lián)盟中資源多樣化程度高，成員之間能夠通過共享機制補充自身不具備的資源。這有助于資源的有效互補和合理配置，節(jié)約交易成本，獲得更大競爭優(yōu)勢，從而更好地發(fā)揮孵化聯(lián)盟的功能，提高科技企業(yè)創(chuàng)業(yè)成功率。
建立深層次聯(lián)盟伙伴合作關(guān)系。孵化器應(yīng)承擔(dān)起加強聯(lián)盟伙伴關(guān)系建設(shè)的任務(wù)，通過定期開展企業(yè)聯(lián)誼會、經(jīng)驗交流會等方式，促進聯(lián)盟成員之間的溝通交流。孵化器應(yīng)幫助創(chuàng)投機構(gòu)獲得企業(yè)更全面、更真實的信息，促進解決信息不對稱問題。這樣，一方面可以降低創(chuàng)投機構(gòu)的投資風(fēng)險，另一方面可以使企業(yè)得到更多融資機會。諸如此類，只有建立深層次聯(lián)盟伙伴合作關(guān)系，進而形成一致的價值觀和利益導(dǎo)向，減少矛盾，形成有效的關(guān)系聯(lián)接，才能提高合作項目成功的可能性。
維護公平的創(chuàng)業(yè)孵化合作環(huán)境。創(chuàng)業(yè)孵化合作過程的公開、公平、公正，不僅有利于減少合作過程中的沖突，而且能夠吸引更多企業(yè)加入，促進孵化聯(lián)盟發(fā)展。為此，應(yīng)探索建立專業(yè)化孵化聯(lián)盟管理機構(gòu)，關(guān)注聯(lián)盟合作、交流、交易的公平性，基于一套公正合理的規(guī)則和程序確保孵化聯(lián)盟運作的有效性。孵化聯(lián)盟管理機構(gòu)應(yīng)積極探索化解個體理性與集體理性沖突的方式，通過加強溝通、平等交流、換位思考，對合作伙伴的不同意見和訴求進行科學(xué)辨識、吸收并作出相應(yīng)策略調(diào)整，努力使合作伙伴形成良好的信任關(guān)系，減少沖突。加盟企業(yè)應(yīng)加強自律，自覺維護孵化聯(lián)盟的共同利益，不投機取巧。
鼓勵市場化的運營管理制度創(chuàng)新。孵化聯(lián)盟應(yīng)通過市場化的運營管理制度創(chuàng)新，實現(xiàn)孵化器、科技企業(yè)、政府、創(chuàng)投機構(gòu)、服務(wù)機構(gòu)等多方共贏，提高政府資金使用效率，提高孵化聯(lián)盟參與方的經(jīng)營績效，解決中小企業(yè)融資難、融資貴等問題。除了現(xiàn)有的以政府財政投入為主要手段的模式，孵化聯(lián)盟還可以依靠自己的創(chuàng)新優(yōu)勢進行風(fēng)險投資、股權(quán)質(zhì)押等多種市場運營，在確保公共資源安全的前提下盤活自身資源，不斷發(fā)展壯大。
加強專業(yè)化的孵化人才隊伍建設(shè)。制定與孵化聯(lián)盟建設(shè)相適應(yīng)的人才隊伍建設(shè)長遠規(guī)劃，建立合理的孵化聯(lián)盟人才評價與激勵機制，吸引各類人才從事科技孵化聯(lián)盟的服務(wù)和運營工作，形成一支專業(yè)化人才隊伍，包括企業(yè)聯(lián)絡(luò)員、創(chuàng)業(yè)輔導(dǎo)員和創(chuàng)業(yè)導(dǎo)師等。
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